Cea mai amplă analiză genetică a identificat trei variante ale coronavirusului SARS-CoV-2. Care este varianta dominantă în Europa

Cea mai amplă analiză genetică a identificat trei variante ale coronavirusului SARS-CoV-2. Care este varianta dominantă în Europa
aprilie 12 12:15 2020 Timp citire articol: 4 minut(e)

Cea mai amplă analiză genetică realizată până acum a identificat trei variante ale coronavirusului SARS-CoV-2 și a recreat traseul pandemiei plecând din orașul Wuhan din China, indicând variantele dominante în fiecare regiune a lumii.

Analiza a fost realizată de cercetători de la Universitatea Cambridge din Marea Britanie, în colaborare cu cercetători din Germania, iar rezultatele sale au fost prezentate săptămâna aceasta în publicația științifică Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).

Cercetătorii au pornit de la analiza a 160 de genomuri ale coronavirusului, din probe prelevate de la pacienți umani, ulterior studiul incluzând peste 1.000 de mostre ale virusului.

Echipa de cercetători a realizat apoi un “arbore genealogic” al virusului și a identificat mutațiile suferite de coronavirusul SARS-CoV-2, care au creat diferite ramuri de descendență.

“Sunt prea multe mutații rapide pentru a putea trasa cu exactitate arborele genealogic al Covid-19. Am folosit un algoritm matematic pentru a observa simultan toate variantele plauzibile de arbori genealogici”, a explicat dr. Peter Forster, genetician la Universitatea Cambridge și autor principal al studiului, citat de sciencedaily.com.

“Aceste metode sunt folosite mai ales pentru a cartografia traseele populațiilor umane preistorice prin intermediul analizei ADN. Cred că este pentru prima dată când aceste metode au fost folosite pentru a stabili traseele unei infecții precum cea a coronavirusului”, a completat dr. Forster.

TREI VARIANTE ALE CORONAVIRUSULUI

Echipa de cercetători a analizat genomul coronavirusurilor din probe prelevate de la pacienți între 24 decembrie 2019 și 4 martie 2020, identificând trei variante distincte ale SARS-CoV-2, pe care le-au numit: tipul A, tipul B și tipul C.

Cercetătorii au descoperit că tipul A al SARS-CoV-2 este cel mai apropiat de cel identificat la lilieci, considerându-l “genomul viral originar la om”.

Coronavirusul de tip A este prezent în Wuhan, locul unde a izbucnit epidemia, însă, în mod surprinzător, nu este tipul predominant în orașul din China. Tipul A a migrat devreme după izbucnirea epidemiei, fiind identificat la un număr mare de pacienți cu Covid-19 din Statele Unite și din Australia.

Însă coronavirusul de tip B este predominant în Wuhan și, în general, în estul Asiei. Tipul B nu s-a răspândit în afara estului Asiei, fiind apărut destul de devreme în Wuhan, unde a ajuns predominant, și în estul Asiei, potrivit cercetătorilor.

Studiul sugerează o posibilă rezistență la această variantă – tip B – a coronavirusului la populațiile din afara estului Asiei.

VARIANTA DOMINANTĂ ÎN EUROPA

Varianta dominantă în Europa este tipul C al SARS-CoV-2, fiind identificată la primii pacienți cu Covid-19 din Franța, Italia, Suedia și Anglia.

Tipul C este absent la pacienții din China continentală, cel puțin în primele luni ale epidemiei, însă a fost descoperit la pacienți din Singapore, Hong Kong și Coreea de Sud.

De altfel, un cluster al infecției SARS-CoV-2 din Singapore a fost identificat, pe baza analizei genetice, ca fiind unul dintre principalele surse ale epidemiei din Italia, arată studiul.

Cercetătorii consideră că analiza lor a recreat în mare parte traseul infecției de la origine până la răspândirea în întreaga lume.

Potrivit studiului, tipul A al virusului este foarte apropiat de coronavirusul identificat la lilieci și la pangolini (cea mai probabilă gazdă intermediară între liliac și om), fiind considerat “sursa pandemiei”.

Tipul B este derivat din tipul A, cele două variante fiind separate de două mutații. Coronavirusul de tip C este “fiul” tipului B, arată analiza.

Prezența extinsă a tipului B în estul Asiei – și slaba răspândire în afara acestei regiuni – ar putea fi efectul unui “eveniment fondator”: o situație de izolare genetică ce apare atunci când, în cazul unui virus, o nouă variană apare dintr-un grup izolat de infecții. Există, însă, și alte posibile explicații.

“Virusul de tip B din Wuhan ar putea fi adaptat din punct de vedere imunologic și ecologic la o mare parte a populației din Asia de Est. Ar putea avea nevoie de o mutație pentru a depăși rezistența pe care o înregistrează în afara estului Asiei. Pare să se observe o rată mai mică a mutațiilor în estul Asiei comparativ cu alte regiuni ale lumii, în această fază inițială a pandemiei”, a afirmat dr. Peter Forster.

Studiul mai arată că primele cazuri de infecție cu SARS-CoV-2 au apărut la oameni între jumătatea lunii septembrie 2019 și începutul lunii decembrie.

  Citește mai multe despre:
  Categorii:
scrie un comentariu

0 Comentarii

Adaugă un comentariu