Nouă metodă de testare genetică prenatală

Nouă metodă de testare genetică prenatală

Oamenii de ştiinţă au dezvoltat un test genetic neinvaziv care poate examina toate genele în sângele persoanelor însărcinate pentru a detecta mutaţii în ADN-ul fetal.

O echipă de cercetători de la spitalele Massachusetts General (MGH), Brigham and Women's (BWH) şi Broad Institute of MIT şi Harvard a evaluat testul prin examinarea probelor de sânge de la 51 de persoane însărcinate, constatând că acesta a fost capabil să capteze variante genetice care au fost moştenite de la mamă, precum şi noi variante care nu erau prezente la mamă şi care au fost asociate cu diagnostice prenatale.

Rezultatele studiului au fost publicate joi, în revista New England Journal of Medicine - NEJM.

„Studiul nostru sugerează că este fezabil să se depisteze majoritatea genelor din genomul fetal cu ajutorul unui test de sânge, mai degrabă decât să fie nevoie de o procedură invazivă, cum ar fi amniocenteza", explică autorul principal Michael E. Talkowski, director al Centrului de medicină genomică al MGH şi profesor asociat de neurologie la facultatea de medicină Harvard.

Metoda este denumită de către echipă secvenţiere fetală neinvazivă (TPNI, în engl. NIFS - non-invasive fetal sequencing).

Testarea prenatală neinvazivă, cunoscută şi sub numele de screening ADN prenatal fără celule, permite unei persoane însărcinate să primească un test de sânge care depistează modificări foarte mari ale cromozomilor fetali, cum ar fi o copie suplimentară a cromozomului 21, cunoscută sub numele de sindromul Down (trisomia 21); câştigarea sau pierderea unor copii întregi ale altor cromozomi; prezenţa şi numărul cromozomilor sexuali X şi Y (care indică sexul fătului) şi, mai recent, un număr mic de variante care sunt relevante pentru unele afecţiuni fetale.

Cu toate acestea, pentru multe diagnostice genetice prenatale, este necesar să se determine modificările individuale ale nucleotidelor în întreaga secvenţă codificatoare de proteine a genomului, cunoscută sub numele de „exom".

În prezent, depistarea exomului necesită efectuarea de teste genetice cu ajutorul unei proceduri medicale invazive, cum ar fi amniocenteza, care implică costuri semnificative şi prezintă anumite riscuri pentru mamă şi făt.

Testul nou dezvoltat ar putea oferi capacitatea de a descoperi şi de a interpreta variantele din exomul fetal din ADN-ul care circulă în sângele mamei.

Abordarea TPNI de înaltă rezoluţie a permis echipei de cercetare să studieze exomul, să descopere modificările secvenţelor genetice şi să distingă variantele potenţial patogene de variantele probabil benigne moştenite de la mamă.

Echipa a testat 51 de sarcini care au cuprins toate cele trei trimestre şi au fost reprezentative pentru populaţia de gravide care primeşte îngrijiri la MGH şi BWH.

Metoda de screening TPNI a folosit o prelevare de sânge matern fără a fi nevoie de un test genetic separat pe mamă sau pe tată.

Echipa de cercetare a constatat că metoda a fost extrem de sensibilă pentru a descoperi modificări ale ADN-ului cu o singură bază şi mici inserţii şi deleţii care erau prezente în genomul fetal, dar nu şi în genomul matern, indiferent de cantitatea de ADN fetal detectată.

„În cadrul analizei retrospective, am reuşit să descoperim şi să estimăm cu precizie variantele secvenţelor fetale din abordarea TPNI cu o sensibilitate de >99% din datele brute şi cu o sensibilitate de >90% după filtrare cu ajutorul metodelor de analiză", a declarat  Harrison Brand, doctor în ştiinţe, cercetător în cadrul departamentului de neurologie de la MGH şi profesor asistent la facultatea de medicină Harvard.

În 14 sarcini care au primit o recomandare de testarea genetică, standardul actual de îngrijire, şi care au fost evaluate şi cu noua abordare, TPNI a detectat toate variantele relevante din punct de vedere clinic care au fost raportate în urma testării invazive la aceste persoane.

Autorii au efectuat iniţial testul pe 51 de sarcini, dar constatările sugerează că testul ar putea fi efectuat potenţial pe mai multe probe.

„Implicaţiile clinice ale acestei cercetări sunt profunde, în special pentru sarcinile în care se suspectează o anomalie fetală în urma ecografiei şi este indicat un test invaziv", spune unul dinttre autorii principali, dr. Kathryn Gray, obstetrician şi genetician clinic la BWH şi profesor asistent de obstetrică şi ginecologie la Harvard, la momentul studiului.

Potrivit autorilor, se ştie de mult timp că variantele de secvenţă fetală pot fi obţinute din ADN fetal fără celule, iar secvenţierea exomului face deja parte din standardul de îngrijire, dar în prezent necesită o procedură invazivă.

Acum, aceste rezultate sugerează că secvenţierea non-invazivă poate capta probabil aceleaşi informaţii genetice din exomul fetal care sunt deja obţinute în cadrul standard-of-care, dar numai dintr-un test de sânge, fără procedura invazivă, precizează autorii studiului.

Echipa lucrează în prezent cu alţi cercetători pentru a extinde şi valida aceste rezultate şi pentru a optimiza în continuare metoda, subliniind că acesta nu este în prezent un test clinic şi că aceste studii timpurii vor trebui să fie reproduse pe eşantioane mult mai mari.

viewscnt